Naoya Hatakeyama nació en 1958 en Rikuzentakata, prefectura de Iwate, Japón. Estudió con Kiyoji Otsuji en la Escuela de Arte y Diseño de la Universidad de Tsukuba, donde completó sus estudios de posgrado en 1984. Desde entonces, reside en Tokio y ha participado en numerosas exposiciones individuales y colectivas tanto en Japón como en el extranjero. En 1997, ganó el 22.º Premio Kimura Ihei por su fotolibro  Lime Works  (Synergy Geometry, 1996), que retrata minas de piedra caliza, fábricas de cal y plantas de cemento repartidas por todo Japón, y por la exposición «Maquettes» en la Galería NW House.

Hatakeyama participó en la 49.ª Bienal de Venecia en 2001 y recibió el 42.º Premio Mainichi de Arte. En 2012, recibió el Premio de Estímulo Artístico del Ministro de Educación, Cultura, Deportes, Ciencia y Tecnología por su exposición individual a gran escala “Natural Stories” (Museo de Arte Fotográfico de Tokio), que repasaba su carrera desde sus primeros trabajos hasta Rikuzentakata, un retrato de su ciudad natal después del Gran Terremoto del Este de Japón. En la 13.ª Exposición Internacional de Arquitectura de la Bienal de Venecia, fue galardonado con el León de Oro por su participación en el Pabellón Japonés. Sus publicaciones incluyen  BLAST  (Shogakukan, 2013),  Kesengawa  (Kawade Shobo Shinsha, 2012) y  Rikuzentakata 2011-2014  (Kawade Shobo Shinsha, 2015). Sus obras están incluidas en las colecciones de Tate, Londres; Museo de Arte Moderno, Nueva York; Museo Metropolitano de Arte, Nueva York; Museo de Bellas Artes, Houston; La Maison Européenne de la Photographie, París; Fundación Suiza para la Fotografía, Winterthur; Museo Nacional de Arte Moderno de Tokio; Museo de Arte Fotográfico de Tokio; y el Museo Nacional de Arte de Osaka.